Una de las sorpresas que trajo Messiah (Mesías, por su título en español) es la inclusión dentro de su elenco principal de personajes homosexuales. Si bien, ninguna escena de la serie contempla un beso entre dos personas del mismo sexo y mucho menos una escena de sexo gay, hay indicios que indican más allá de toda duda que tres de sus personajes no son heterosexuales: Jibril (Sayyid El Alami), Samir (Fares Landoulsi) y el agente Will Mathers (Wil Traval).
Si bien, al inicio la relación que se da entre Jibril y Samir, parece ser simplemente la de amigos, una vez están en el campamento al borde de la frontera con Israel, ambos empiezan a tener una cercanía especial. Jibril no sabe leer, y por eso Samir le lee pasajes de un libro de cuentos fantásticos.
Llega un momento, en que Jibril y Samir se miran y finalmente se toman de la mano, pero inmediatamente Samir expresa que le ha prometido a su padre, conservar el nombre de la familia, queriendo decir que sabe, reconoce y acepta que se siente atraído por Jibril, pero que por un compromiso familiar debe casarse y tener descendencia. A esto último volveremos luego.
Incluso, es Samir quien pone de hecho que Jibril también le gustan los hombres cuando lo enfrenta sobre su postura sobre al-Masih, insinuando que la devoción que Jibril siente por el enigmático individuo no parte de la fe religiosa, sino de la atracción. Finalmente, ambos se separan, para finalmente volverse a ver, en el ataque en el que Samir se inmola, y al que Jibril sobrevive. Una historia de amor trágica.
Sin embargo, pareciera ser que en efecto Samir al menos creyó estar cumpliendo la voluntad de su padre, cuando se casó y suponemos, que tuvo relaciones sexuales con la mujer que lo abordó en el nido de terroristas donde lo adoctrinaron.
Ahora, sobre el agente Will Mathers, sabemos que en efecto estuvo casado, y que dentro de su matrimonio casi inmediatamente hubo situaciones conflictivas porque Will no le gustaban las mujeres, lo que aunado a su situación laboral, en la que le queda muy poco tiempo para intentar resolver cualquier asunto, finalmente terminó en su matrimonio.
La confirmación de que Will Mathers es gay son las dos conversaciones telefónicas que tiene con su compañero, la primera tras la que Eva finalmente se convenció de que Mathers no tenía novia, sino novio, y la segunda en la que Mathers finalmente acepta que debe dejar de cazar a Golshiri y empezar una nueva vida con su compañero.
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